由于冬季棚室内湿度比较大，空间又小，空气流通不畅，重茬、迎茬现象严重，所有这些对棚室蔬菜病虫害的发生和流行都十分有利。特别是蔬菜定植后，病虫害发生后防治效果不佳。这主要是因为：
1、棚室内空间小，喷雾效果不佳。
2、随着药量浓度的不断加大，病菌和害虫抗药性增强，防治成本也增加，蔬菜污染将更加严重。
冬季棚室蔬菜定植后，发生的主要病害有：黄瓜霜霉病、角斑病、炭疽病、白粉病、黑星病、菌核病；番茄叶霉病、灰霉病、疫病、青椒炭疽病等。主要虫害有：蚜虫、红蜘蛛等。
针对以上病虫害的发生特点，冬春棚室蔬菜进行病虫害防治时，应采取以下三种方法：
一、药水定植： 用90％的乙磷铝500倍液加70％的甲基托布津1000倍液或25％的多菌灵500倍液进行定植灌根，可有效地防治多种病虫害的发生和危害。
二、应用烟剂： 应用近年来研制开发的新药棚菌灵和棚虫灵烟剂。该药粉通过加温后，由固体变为气体状态，缓慢漂浮、弥漫，充满棚室空间，均匀地沉积在蔬菜各个部位。同时，施放烟剂还可以降低棚室内的空气湿度，减少蔬菜叶片上夜间的结露量，减少蔬菜叶片上病菌孢子的发芽量，起到生态防治病害的作用，且80％以上的烟剂飘落到蔬菜表面上，有利于充分发挥药效。
棚菌灵烟剂可防治多种病害，主治黄瓜霜霉病、白粉病、炭疽病、黑星病，兼治番茄疫病、叶霉病、斑枯病等多种真菌性病害，其防治效果比常规喷雾施药法高20％，每亩（667平方米）可增产蔬菜1000公斤。
棚虫灵烟剂是一种虫、病双治的烟剂新品种，对害虫杀灭速度快、效果好。对蚜虫防治效果可达98％以上；对白粉病的防治效果可达90％以上。
三、应用粉尘剂： 粉尘剂就是把固体农药研磨成很细的、能通过300目以上细筛的药粉，用喷粉器喷粉，使农药在棚室内形成飘尘每次每亩（667平方米）喷施粉尘剂1公斤左右。即使在棚室密闭不严的情况下，粉尘也能滞留在棚率内，均匀沉积在蔬菜的各个部位，起到烟剂一样的效果。粉尘施药法防治效果可比常规的喷雾施药法提高40％以上。
目前，我国粉尘剂定型的产品有百茵清粉尘剂、敌托粉尘剂、脂铜粉尘剂和灭克粉尘剂等品种。
