胶质芽孢杆菌能分解土壤中硅元素供植物利用，使得植物的蜡质层增厚，提高植物保水能力。胶质芽孢杆菌通过菌体细胞在种子或作物根系周围生长繁殖，在其代谢过程中产生大量的有机酸和酶，使土壤中难溶的硅铝酸盐等矿物分解，K、P、Si、Mg、Zn等以离子形式释放出来，供植物根系吸收、利用。
硅酸盐菌在土壤中生长、繁殖，分解土壤中偏硅酸盐等不溶性矿物质，使得植物能够从土壤中摄取大量的硅，从而使得植物的蜡质层增厚，提高植物的非特异性免疫能力和保水能力。
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