同时又能补充蔬菜所需的锰、钾两种营养元素，可提高蔬菜产量，具有肥药双重作用。因此，高锰酸钾是一种肥药两用，无毒、无残留、无公害的蔬菜杀菌剂。目前使用方法除了种子消毒外，还有喷雾和灌根两种方法。
首先，种子消毒。用0.1%-0.15%的高锰酸钾溶液浸泡番茄、茄子、辣椒等茄科蔬菜种子15-20分钟，可防治病毒病、早疫病、炭疽病、褐斑病等。而西瓜种子用高锰酸钾1000倍液浸种8-10小时，可防治枯萎病。但要注意的是，种子在经高锰酸钾溶液浸种后，要用清水冲洗干净，然后才能催芽播种或晾干后播种。
其次，喷雾。对瓜类蔬菜苗期的猝倒病，在出苗后每隔7-10天用高锰酸钾溶液1000倍液喷雾，连续防治3次，发病率可控制在2%以下。辣椒等茄果类蔬菜花卉感染病毒初期，用高锰酸钾800倍液，西葫芦等瓜类初期则用1000-1200倍液对全株进行喷雾，每隔5-7天喷1次，连喷3至4次，可控制病毒病的蔓延。
再次，灌根。用高锰酸钾800-1000倍液全田逐株灌根，每隔10天灌一次，连灌2-3次，对西瓜、冬瓜的枯萎病可取得显著的防治效果。用高锰酸钾500倍液或800倍液灌根，每7天1次，共灌3-4次，能有效防治辣椒根腐病和茄子猝倒病。高锰酸钾若在苗床防病中应用，使苗床湿润即可，使用后要用清水冲洗一下叶面，防止其受害。
另外，高锰酸钾溶液不可与其他农药混合使用，配制高锰酸钾溶液时，用清水即可，不可用热水，随用随配，不可久放。无论喷雾或灌根都要在蔬菜发病初期进行，喷雾要在上午9时左右或下午4时以后进行。幼苗7叶前喷药，要在喷药后5分钟后及时用清水冲洗。而且幼苗期要用低浓度，成株期用高浓度。药物器械使用后，及时用清水冲洗，以免被氧化蚀损。
