该实验室由总局于2009年批准筹建，实验室依托烟台局检验检疫技术中心，主要负责烟台辖区进、出口水果、蔬菜及其制品的安全检测。检测领域包括农药残留、食品添加剂、重金属、常规理化、放射、辐照、微生物等，实验室现拥有10万元以上大型仪器设备30余台（套），包括气相色谱-质谱联用仪、气相色谱-串联四级杆质谱联用仪、液相色谱-串联四级杆质谱联用仪、电感耦合等离子体质谱仪等高精尖仪器设备。实验室筹建期间，成功处置过多起食品安全突发事件，包括“有毒青刀豆”事件、“日本毒饺子”事件、“三聚氰胺毒奶粉”事件、“塑化剂毒饮料”事件、“德国草莓诺如病毒”事件、“韩国方便面中苯并芘”事件、“葡萄酒中农残检出”事件等。
日前，国家质检总局公布了2013年度通过核查验收的45家国家检测重点实验室名单，由山东烟台检验检疫局负责筹建的国家果蔬及制品检测重点实验室位列其中，成为烟台局建设的第二个国家级检测重点实验室。
