在黄瓜育苗过程中，通风主要是为了很好地调节苗床环境的温度、湿度和补充必要的二氧化碳气体。通风量的大小和通风时间的长短依据苗床内的温度及外界气温来决定。
对于采用阳畦、温床设施进行黄瓜育苗时，玻璃床框覆盖的应将窗框下拉、错放，如果窗框上的玻璃是活动的，可将玻璃下拉、撤掉，先从上部通风，而且通风口每天交错调换，这样可使苗床内的幼苗温度均匀，都得到炼苗的机会，使幼苗生长健壮整齐。
塑料薄膜苗床有平盖、斜盖、半拱和全拱等覆盖形式，其通风方法也不同。平盖、斜盖通风较困难，效果也差，一般开始时可将背风面用土压住的薄膜隔一段将土扒开，用细竹竿卷成拱形支起来，以后逐渐加大通风口。半拱或拱形覆盖的苗床通风比较容易，最初可以将苗床两端的薄膜揭开卷起，进行小通风，进一步可以将背风面的压土去掉，将薄膜上提、上卷进行通风，然后再在拱棚薄膜外，在两个拱架之间插夹一个拱形细竹竿夹住薄膜，然后将薄膜上推和下拉即可调节通风口的大小。
采用日光温室、塑料大棚进行黄瓜育苗时，通风相对比较容易，如果是玻璃温室，先在顶窗通风，以后再通底窗的风；薄膜温室、塑料大棚一般是两道缝或三道缝，先打开上部的缝进行顶通风，逐步再打开中部的缝通风，最后放底风。开始通风时，要隔一段扒一段缝通风，并用小棒支撑着薄膜。每天轮流放风。
幼苗时，上午达到25℃时开始通风，下午温度降至18℃左右时停止通风。通风时要逐渐进行，通风口随着气温的上升逐渐加大，避免通风过快、过猛，要在背风面放风，避免冷风直接吹到幼苗。随着外界气温的升高，通风量逐渐加大，通风时间逐渐延长。
