有机肥，可起到增强土壤透气性、提高地温、均衡供应营养等多重作用。连年种植、连年过量使用化学肥料造成土壤板结，这在一程度上可以说是造成根系受伤或者烂根死棵的罪魁祸首，因而改善施肥情况，减少化肥用量，重施有机肥，改良土壤，促进生根，确保一大茬黄瓜整个生育期正常生长是越冬黄瓜获得高产的重要砝码。
有机肥，如鸡粪、牛粪，亩用量宜在20~25方，但在使用前必须充分腐熟，以免造成烧根熏苗或者引发病虫害。
2、高垄栽培 提高地温
起垄定植是普遍采用的种植方法，但多数菜农是将黄瓜种在垄的斜坡上，而不是直接种在垄顶上，这样虽然能够起到提高地温的作用，但同时存在因浇水施肥不当而造成伤根的危险。因而，越冬黄瓜更适宜高垄垄顶栽培。
垄高20厘米、宽20厘米即可，这样不仅利于增大垄面的见光面积，利于提高地温，而且还会改善连年使用旋耕机翻地而造成的地表15厘米以下耕作层变硬、透气性差的现状，从而更利于根系的生长。
3、定植露坨 施生物菌肥
黄瓜的根系分布较浅，多分布于5~30厘米的土层内，好气性强，有氧呼吸旺盛，在含氧量高的土壤中发育良好。定植切勿过深，露坨利于定植后根系的发育。
根部病害是近年来棚室黄瓜生产中的主要问题之一。穴施生物菌肥可以利用以菌抑菌的方法预防根部病害，同时还可促进生根，利于蔬菜形成壮棵和蔬菜产量的提高。可亩施落地生根抗死棵生物肥80~120公斤，沟施或穴施皆可。
4、肥水合理 根系发达
如果一次性浇水过多，使土壤水分过多，会降低土壤氧气含量，不利于根系正常呼吸而发生伤根。若一次性施肥量过大会造成土壤溶液盐离子浓度过大，易造成烧根。
另一方面，水分少时，土粒对水分、养分吸附能力增加，这些都阻碍根对养分和水分的吸收。因此，要合理浇水施肥。可根据土壤干湿状况、蔬菜生长需求情况控制浇水施肥量，避免浇水施肥量过大造成伤根或烧根。对于已发生根系受伤而产生黄叶的，应及时进行防治。
采用叶面喷施、地下灌根相结合的方法，可叶面喷施细胞分裂素600倍混加核苷酸叶肥500倍，防止叶片老化；灌施生根剂1500倍以促进生根。
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