无论是直播或育苗，苗出齐后，都要进行行间定苗。间苗要早，以免植株拥挤互相遮荫，争肥夺水。黄芪一般间苗2—3次，第一次在苗高 6厘米 时进行，第二次在苗高10— 12厘米 时进行，然后进行定苗。穴播的每穴留苗3—4株，条播的每隔10— 12厘米 留壮苗1株，育苗每2— 3厘米 留苗1株（可将间出的大苗移栽，让小苗继续生长），剔除弱苗、小苗、病苗，留壮苗。定苗时，若有缺苗，应进行补植，补苗需在阴天或晴天的午后或傍晚进行，用苗可事先培育或从间下苗中选用。栽后注意浇水。补植之苗多分枝，故缺苗过多时，最好用催过芽的种子重新播种。
黄芪以根入药，其产量由单株根重和单位面积上植株数量两个因素构成。近几年栽培实践表明，适当密植可以增加叶面积指数，能适当提高黄芪产量，但根重有所下降，黄芪品质有所降低，综合考虑，黄芪亩种植密度应以1．8万—2万株左右为宜。肥水条件好，土壤肥沃，养分充足的可适当密植；肥水条件差，养分不足的应稀一些。
2、中耕除草：
黄芪幼苗生长缓慢，出苗后往往草苗并长，若不注意，很易造成草荒，因此应及时除草。除草一般结合中耕进行。中耕可疏松土壤，切断土壤毛细管，防止水分蒸发，起到防旱保墒的作用。大雨和久雨之后，中耕又起到散墒除涝的作用。民俗“锄头有水”、“锄头有火”讲的就是这个道理。中耕一般每年进行3—4次。苗高 5厘米 左右时结合间苗进行第一次中耕除草；苗高7— 8厘米 时进行第二次中耕；定苗后进行第三次中耕，以后视田间杂草情况进行。第二年以后于4月、6月、9月各中耕一次。中耕深度一般按苗期浅，成株深，苗旁浅，行中深的原则进行，做到不伤苗，不埋苗，不伤根，不留草。锄细、锄匀，不漏锄。
3、追肥：
黄芪喜肥。除了施足基肥，为了满足不同生育期对养分的需要，提高产量，在生长第一、二年，每年结合中耕除草追肥3次。第一次追肥结合第二次中耕除草进行，要轻施和偏施，小苗多施，大苗少施，以促小苗赶大苗，变弱苗为壮苗，达到苗齐、苗匀、苗壮的目的。一般亩施人粪尿 1000千克 或用硫酸铵 15千克 兑水浇施。第二次结合第三次中耕除草进行，每亩用堆肥 1500千克 、过磷酸钙 50千克 、硫酸铵 10千克 混合均匀后在行间开沟施入，施后覆土。第三次在入冬苗枯后每亩用厩肥 2000千克 加过磷酸钙 50千克 、饼肥 150千克 后混合拌匀施入田间，施后培土防冻。
4、灌溉排水：
黄芪苗期耗水量少，为促进根系下扎，增加根部长度，提高黄芪产量，在足墒播种的情况下，可以不浇水。若底墒不足，天气干旱，应用小水或隔行灌溉，切勿大水漫灌。在结果种熟期，如遇高温干旱，也应及时灌水，促使种子正常成熟，降低硬实率，提高种子质量。雨季土壤湿度过大，会导致根部腐烂，易积水的地块应注意及时排水，降低土壤湿度，以利根部正常生长。
5、打顶、摘蕾打顶摘蕾可以打破主茎顶端的生长优势，抑制黄芪株高，控制地上植株生长，减少养分消耗，促进根部生长，提高黄芪产量，是黄芪高产栽培的一项重要内容，据生产调查，一般可增产15．4%左右。
摘蕾一般于6月中旬出现花蕾时，将其摘除，通常每年摘蕾3—4次。打顶则要“适时”，打顶过早，会影响地上部分生长，降低叶面积系数，影响光合作用。降低产量，打顶过晚，则起不到应有的作用。根据黄芪生长发育特点，适时的打顶时间宜在7月下旬。
6、越冬期管理：
黄芪是多年生植物，从地上部枯萎，根头越冬芽形成到第二年返青前需要经历180—190天左右，搞好这一阶段的管理工作对黄芪第二年生长发育至关重要，生产上要采取必要措施，做好黄芪的越冬管理工作。
（1）清理田园：冬前黄芪地上部枯萎后，要及时清除枯枝落叶，并集中烧毁或堆沤，消灭越冬病虫源，减少翌年病虫害的发生。
（2）施肥培土：冬季枯苗后，每亩用腐熟厩肥 2000千克 、过磷酸钙 50千克 、饼肥 150千克 混合拌匀后平铺在根头上，再深挖理通沟道，将沟泥覆盖于肥料上，以防止根部受冻。
（3）灌水防冻：因水的比热较大，灌水可提高土壤的热容量，有一定的防冻作用。灌水宜在立冬前一次灌透。
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