小麦拌种主要防治以下病虫害：
1.土传病害，主要是纹枯病、全蚀病、根腐病。这些病菌在土壤中可以存活多年，在小麦拌种后种子开始萌芽时病菌就可以侵染。
2.系统侵染病害，主要有杆黑粉病、散黑穗病和腥黑穗病，病菌从种子萌发侵入生长点，随小麦植株生长进行系统侵染。穗期表现危害症状。
3.地下害虫，主要是蛴螬、蝼蛄和金针虫，它们在秋苗期和返青后咬食小麦根茎部，造成缺苗断垄。有效的方法是药剂拌种。
4.地上害虫，主要是灰飞虱等。
小麦拌种使用技术指导：
1.全蚀病区种子处理
可选用70%甲基托布津可湿性粉剂按每亩2-3千克加细土20~30千克，均匀施入播种沟进行土壤处理。小麦全蚀病严重发生区，可选用12.5%硅噻菌胺悬浮剂进行种子处理，对小麦全蚀病有很好的防治效果。拌均后闷种6～12小时，在阴凉处晾干后播种。
2.黑穗病种子处理
用12.5%烯唑醇15克加入3千克水，拌30千克麦种，拌匀后堆闷10小时播种。
3.地上害虫种子处理
使用70%吡虫啉可分散粉剂(福蝶等产品均可)10克拌1千克玉米种子进行包衣。
4.根腐病、黑穗病、纹枯病及地下害虫种子处理
40%甲基异硫磷或50%辛硫磷100ml 或0.2%的多菌灵可湿性粉剂，拌种50公斤，对蝼蛄、蛴螬、金针虫等地下害虫有特效。
小麦拌种剂使用注意事项：
1.拌种剂存放：要严格按照拌种操作规程，最好实行统一拌种，拌种剂应放在坚固密闭的容器内，贴上标签，存放在远离火源、热源且小孩、家畜不能接触到的凉爽干燥处。禁止与食物、饮料等混在一起放置。防止人畜中毒。
2.安全操作：拌种时工作人员，戴好橡胶手套，做好保护工作。如有中毒现象，请到就近医院。
3.随拌随播，不可久置：一般小麦用杀菌剂拌种后，应随即播种或阴干后立即播种。拌种后的种子，如用不完剩下的要销毁，不要长时间存放。
4.准确掌握农药用量：小麦拌种剂是为了小麦更好的生长。如果小麦拌种剂量使用不当，对小麦生长危害很大。如果用量过大，导致小麦出苗推迟，生长缓慢，严重者甚至会出现缺苗断垄，因此应特别注意。农户在小麦药剂拌种时不能凭“估计”用药，盲目加大用药量。应该按照使用标准来加拌种剂药用量。
提示：病虫混合发生区，推广杀虫剂、杀菌剂混合拌种技术。一般先将杀虫剂按要求比例加水稀释成药液，用喷雾器将药液均匀喷洒于种子，堆闷3~4小时摊开晾干后再拌杀菌剂，如果加拌微肥、增产菌等，要随拌随种；拌种时须注意的是粉锈宁拌种要干拌，若用其他药剂进行湿拌或乳油拌种时，拌匀后立即晾干，严禁多种药剂混拌种，以免发生药害。
种衣剂优劣的简单判别方法：
1.种子包衣晾干后，磨擦有粉尘脱落现象，往往是劣质或假种衣剂；
2.优质种衣剂为半透明薄膜附着在种子表面，色泽均匀一致，能透视到种子皮色，而劣质种衣剂则往往颜色过深；
3.假种衣剂有强烈刺鼻、刺眼现象，部分假种衣剂由杀虫农药掺入颜料调制而成，有杀虫农药的气味，操作不当对种子发芽率影响特别严重。
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