收获后的大豆籽粒会从土壤中带走大量的养分元素，因此，对于肥力较低的土壤特别是含磷量较低的土壤，启动肥对于大豆生长至关重要。通常，启动肥施用于玉米的效果要优于大豆。这是应为大豆定植时的土温高于玉米。 虽然启动肥在大豆上很难获得像玉米早期长势那样的良好表现。但在肥料较低的缺磷土壤上，启动肥却对大豆的生长有着直接的影响。
美国堪萨斯州对于大豆种植的指导方案中，包括测定土壤中的磷、钾、硫、锌、硼等元素。如果土壤测定结果显示某种元素的缺乏，那么相应的肥料可以直接用于大豆，或者间接的通过增加大豆上季轮作作物的施肥量来改善下一种植季的土壤肥力水平。
在大豆上使用启动肥最有效的情况应该是补充土壤急需的某种养分元素，或者土壤肥力处于中低水平，利用启动肥可以有效地拉动大豆来年的产量潜力。此外，在轮作的种植制度下，大豆启动肥可以补充高产作物如玉米从土壤中带走的养分，从而帮助土壤保持平衡的肥力水平。
在大豆上使用启动肥最有效的方式应该是，在播种时将启动肥条播与种子下方和侧方。对于免耕和减耕的大豆田块来说，种侧条播比土表撒播肥料会使磷钾元素的更加有效的在土壤中移动，从而被作物吸收。
然而，对于行间距较窄的大豆来说，不宜深耕条播肥料，因为在肥料离种子距离太近会造成烧苗，这种情况下，只能选择土表施肥。
通常大豆的启动肥中不需要加入氮元素。然而，一些针对灌溉施肥的研究表明，在启动肥中加入少量的氮会为大豆创造出高产潜能的生长环境。
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