第一点：常施生物菌，早防雨水传病
雨水灌棚后其所携带的病菌会侵染根系，因此控制土壤中原有的有害菌以及雨水带来的有害菌的滋生繁殖十分关键。若是土壤中的有益菌数量充沛，则完全不必担心这一点。在生产中经常补充使用有益微生物产品，如木美土里、极靓微生物菌剂等等。通过有益菌以菌抑菌的特性来达到预防有害菌的目的。
第二点：要适时划锄
当雨水下渗或排走以后，棚地土壤见干见湿时，及时划锄，以透加土壤的透气性，促使蔬菜根系尽快恢复正常生长。划锄的深度根据蔬菜根系生长情况而异，如刚定植的蔬菜遭到雨水淹，因根系未大面积扩展，划锄的深度可深一些；如苗期根系已经扩展下扎，可将划锄深度控制在3厘米左右，且不要靠植株太近。
第三点：根据情况用药预防
一旦发现蔬菜有死棵的情况，须立即察看病因，并及时用药干预。一般来说，可用30%的恶霉灵水剂1000倍液或50%的氯溴异氰尿酸1000倍液灌根。灌根时可配合适量的生根剂或甲壳素，促进伤根修复和再生。
