一、砧木选择
常用砧木品种为辣椒的野生种，如台湾的PFR-K64、PER-S64、LS279品系，是辣椒嫁接栽培专用砧木。甜椒类可用“土佐绿B”嫁接。有些茄子嫁接用砧木，如超抗托巴姆、红茄、耐病VF也可用于辣椒嫁接栽培。
二、嫁接方式
当砧木具4-5片真叶、茎粗达5mm左右，接穗长到5-6片真叶时，为嫁接适期。嫁接用具主要是刀片和嫁接夹。使用前，将刀片、嫁接夹放入200倍的福尔马林溶液浸泡1-2h进行消毒。嫁接场地的光照要弱，距苗床要近。嫁接苗床在温度较低的冬季或早春，应选用低畦面苗床；高温和多雨季节，选择高畦面苗床。嫁接场地周围洒些水，保持90%以上的空气湿度，气温宜在25-30℃，保持散射光照，嫁接场地应用500倍多菌灵药液，或600倍百菌清药液，对地面、墙面以及空中进行喷雾消毒。用长条凳或平板台作嫁接台。嫁接前一天，用600倍的百菌清或500倍的多菌灵对嫁接用苗均匀喷药，第2天待茎叶上的露水干后再起苗。嫁接前，将真叶处的腋芽打掉。采用靠接、插接、等嫁接方法。
1、插接法
插接一般在播种后20-30天进行，砧木有4-5片真叶时为嫁接适期，辣椒苗应较砧木苗少1-2片叶，苗茎粗比砧木苗茎稍细一些。嫁接时，在砧木的第1或第2片真叶上方横切，除去腋芽，在该处顶端无叶一侧，用与接穗粗细相当的竹签按45-60°角向下斜插，插孔长0.8-1cm，以竹签先端不插破表皮为宜，选用适当的接穗，削成楔形，切口长同砧木析插孔长，插入孔内，随插随排苗浇水，并扣盖拱棚保护。插接法的操作工序少，简单省事，嫁接功效比较高，通常一般人员每天可嫁接800-1000株；嫁接部位不易发生劈裂和折断，辣（甜）椒和砧木间的接合比较牢固；嫁接后辣（甜）椒与砧木间的苗茎结合面积较大，对辣（甜）椒和砧木间的上下营养畅流有利，有利于培育壮苗。
2、靠接法
嫁接后接穗的根仍旧保留，与砧木的根一起栽在育苗钵中，嫁接后接穗不易枯死，管理容易，成活率高。每个育苗钵内栽1株砧木苗和1株辣椒苗，高度要接近，相距约1cm远。先在砧木苗茎的第2-3片叶间横切，去掉新叶和生长点，然后从上部第1片真叶下、苗茎无叶片的一侧，由上向下呈40°角斜切1个长1cm的口子，深达苗茎粗的2/3以上。再在接穗无叶片的一侧、第1片真叶下，紧靠子叶，由下向上呈40°角斜切1个1cm的口子，深达茎粗2/3，然后将接穗与砧木在开口入互相插在一起，用嫁接夹将接口处夹住即可。
靠接法属于带根嫁接法，嫁接苗不容易失水萎蔫，成活率高；对苗床环境变化的反应不甚敏感，比较容易管理；辣（甜）椒苗嫁接在砧木苗茎的中上部，此部位的砧木比较粗，较容易进行苗茎的削切和结合操作，技术简单易学，易掌握；辣（甜）椒苗的嫁接位置偏低以及辣（甜）椒苗切断苗茎后留茬太长，苗茎已产生不定根，防病效果不理想；茄苗和砧木的切口较深，嫁接苗较容易从苗茎的接合处发生折断或劈裂，造成死苗。
3、劈接法
劈接法属于顶端嫁接法，苗穗离地面较高，结合部位也不留多余的段茎，不容易遭土壤污染，嫁接防病效果比较好；技术简单，易学，容易进行嫁接操作，嫁接质量也容易掌握；嫁接苗成活期间对苗床的环境要求较为严格；嫁接苗的成活率受管理水平的影响很大，成活率不容易掌握；劈接苗的接口处容易产生劈裂。
三、嫁接方法选择
1、根据辣（甜）椒苗的大小选择嫁接方法一般来讲，大苗由于苗茎比较粗硬，易于劈裂，应选择劈接法、靠接法等进行嫁接。用小苗嫁接时可选择插接法。
2、根据嫁接育苗的目的选择嫁接方法如果以防病为主要目的，应选择防病比较好的劈接法、插接法等进行嫁接。如果防病并不是主要目的，可根据其他情况选择适应的嫁接方法即可。
3、根据嫁接育苗技术水平选择嫁接方法如果当地的辣（甜）椒嫁接育苗经验丰富，技术水平比较高，应优先选择防病比较好的劈接法、插接法进行嫁接。如果当地以前没有进行过辣（甜）椒嫁接育苗，最好选择嫁接苗成活率比较高的靠接法。
4、根据育苗季节选择嫁接方法高温期育苗，苗床温度偏高，嫁接苗容易失水萎蔫，嫁接成活率一般偏低，苗床管理要求比较严格，如果育苗条件不好，应选择嫁接苗成活率相对比较高的靠接法，育苗条件好时可根据嫁接育苗的技术掌握情况选择其他嫁接方法。低温期育苗，应尽可能选择劈接法和插接法，以提高嫁接苗的壮苗率。
5、根据育苗条件选择嫁接方法育苗条件比较好的地方，应优先选择有利于培育壮苗的插接法，育苗条件较差的地方，应首先选用劈接法和靠接法。
四、嫁接后苗床管理
嫁接苗愈合的适温，白天为25-26℃，夜间20-22℃。温度过低或过高都不利于接口愈合，影响成活，温度超过32℃，要用草苫、遮阳网等对苗床进行遮荫，最低不能低于20℃，低温期要安排在晴暖开进行，并加强苗床的增温和保温工作。在接口后3天，必须使空气湿度保持在90%以上，以后几天也要保持在80%左右，可于嫁接后扣上小拱棚，棚内充分浇水，盖严塑料薄膜，密闭一段时间，使小棚内空气湿度接近饱和状态，以小棚塑料薄膜内表面出现水珠为宜。接口基本愈合后，在清晨或傍晚空气湿度较高时开始少量通风换气，以后逐渐延长通风时间并增大通风量，但仍应保持较高的湿度，每天中午喷雾1-2次，直至完全成活。
嫁接后的3-4天要完全遮光，以后改为半遮光，逐渐在早晚以散射弱光照射。在能保持温、湿度不会大波动的情况下，应使嫁接苗早见光、多见光，但光不能太强，随着愈合过程的推进，要不断延长光照时间，10天以后恢复到正常管理水平。阴雨天可不遮光。
嫁接过程中，如果遇到茎叶带泥土的苗，要先用600倍的百菌清或500倍的多菌灵药液漂洗干净，晾干后再进行嫁接。嫁接苗培育期间，还要定期喷药保护。辣椒苗上长出的不定根要及早去除，砧木上的侧芽也要及早抹掉。嫁接苗成活后，对靠接苗，还要选阴天或晴天下午，用刀片将辣椒苗茎从接口下切断，使辣椒苗与砧木完全进行共生，断茎后的几天里，要对苗床适当遮荫，1周后，转入正常管理，成活后在高温、高湿及光照不足的情况下，嫁接苗易徒长，应采取控制措施。
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