收集当地土生土长的芒果果实或种子（多胚品种），如湛江土芒、海南土芒、广西扁桃芒、云南小芒、福建红花芒，单胚品种宜作种。采回来的果实去除果肉，用清水冲洗干净，剔除浮水和种壳不坚硬不饱满的种子。如果外地采种，则在采种地处理，把合格的种子置于阳光下晒至种壳干爽，然后掺入椰糠、木炭粉或发酵的木糠等保湿运输，运回的种子按本地采果进行剥壳催芽处理，晾干。
芒果砧木用的种子，应采自生长健壮的树上成熟饱满的果实食用后的种子。在生产上也用从加工余下的种子，甚至购买大量的饱满果实堆烂后取种，种子取出后，立即洗去果肉，晾干，随即播种。要在7天内播完，否则会影响发芽率。
播种前，要先剥壳催芽。对晾干的种子，用枝剪夹住种蒂靠近腹肩部分，向下扭转，种壳沿着缝合线撕开，再将另一侧的种壳撕下，便可取出种子。
2.播种
剥壳后的种子可直播，但催芽后再播的效果更好。催芽方法先堆约12厘米厚的沙床，并淋上水，使沙床湿润，按株距1厘米、行距3～5厘米的规格，将种脐向下，排列在50%～60%荫蔽度的沙床上，然后盖上1厘米厚的干净细沙，并淋足水，以后每天喷水1～2次，保持沙床湿润，并防止地下害虫，20天后种子已基本萌芽。
在幼苗子叶展开之前便可分床，分床时按18厘米×25厘米的规格，按幼苗的大小分开移植，淋足定根水。用营养袋育苗，将幼苗按每袋1枝苗移入袋内，并盖土淋水即可。如果不催芽直接播种，可直接植入营养袋或按18厘米×25厘米的规格播入苗床，以后加强管理便可。
对苗圃地进行翻耕，深度20厘米，把土打碎。耕翻前用厩肥加入过磷酸钙熟化后按每667平方米施厩肥3000～4000千克 过磷酸钙30千克用量施入土中，充分均匀。然后用17厘米×25厘米营养袋把混匀后的营养土装袋，袋子（聚乙烯塑料袋）埋入土中，按行摆放，每行宽度以能摆6个袋子为宜，长度视地块而定，畦距60～80厘米。
3.幼苗管理
砧木苗根系浅、弱、组织幼嫩，抗逆力差，易受病虫为害，要加强保护和管理工作。
（1）淋水：遇干旱要经常淋水，特别是刚萌发的苗要天天淋水，保持苗床湿润，但不能积水。
（2）遮荫：种子萌发至幼苗生长，子叶转绿之前，要适当遮荫，最好在苗床上用50%～75%透光率的黑色遮光网搭荫棚，以防日灼伤幼苗。
（3）间苗分床：幼苗分床在嫩芽刚出土、叶片尚未展开或第1次叶片老熟而未出第2次梢时移植成活率最高。因为这两个时间分床，幼苗侧根多，同时种胚贮存的养分还可继续供幼苗的生长，如在第1次出芽叶片展开而未转绿时或出第2次梢后分床成活率低。分床时不要伤根，连胚带根移栽。有的品种一个种子可以出几株小苗，要小心地将胚连苗分开，不要弄断胚乳。
为了提高苗木的生长整齐度和成活率，移苗时要将大、中、小苗分开种植。芒果育苗现在提倡育袋苗，因为袋苗种植后成活率高，生长快。分床的苗直接移栽到营养袋中，植后淋水、遮荫，以后每隔1～2天淋水一次直到成活。
（4）防治病虫害：幼苗的主要的病虫害是尾夜蛾和炭疽病。
（5）施肥：苗木成活后，施肥一次，以后每隔1个月施肥一次，用0.5%的尿素和1%的复合肥液交替淋施。半年后每1.5个月一次，可雨后撒施或撒后灌水，每667平方米施尿素5千克或复合肥5千克，交替使用。
幼苗抽嫩梢未转绿前每隔7天喷一次敌百虫800～1000倍 多菌灵200倍或高效灭百可400倍 甲基托布津1000倍，连喷3次。
