(1)选用天正秋玉1号萝卜等抗黑斑病品种。
(2)大面积轮作,收获后及时翻晒土地,清洁田园,减少田间菌源。
(3)增施充分腐熟的有机肥,加强管理,提高萝卜抗病力和耐病性。
(4)种子消毒,用种子重量0.4%的50%福美双可湿性粉剂或75%达科宁可湿性粉剂、或50%异菌脲可湿性粉剂拌种。 (5)药剂防治。对链格孢菌引致的黑斑病有效的杀菌剂有:75%百菌清可湿性粉剂500-600倍液,50%异菌脲可湿性粉剂1000倍液,58%甲霜灵·锰锌可湿性粉剂500倍液,80%代森锰锌可湿性粉剂600倍液。防治该病最好的时期为发病前开始用药。隔7-10天1次,连续防治3-4次。使用代森锰锌的每个生长季节只能喷1次,防止锰离子超标。