1、科学选择土壤
宜选择生态环境良好，环境评价合格，经有机认证机构认证，远离机场、公路、工厂、生活垃圾物等污染源且排灌良好地块;宜选择具有3年有机土壤转换期，前3年未种过黄瓜的阳光充足、排水良好、疏松肥沃、腐殖质丰富的沙质壤土或壤土;土壤条件符合全国第2次土壤普查土壤养分分级3级以上标准，土层深度要求在40 cm以上;土壤pH在5～7之间，地下水位1.0 m以下。
2、品种选择
选用抗病、抗逆性强、高产、优质的品种，如翠玉一号、秋抗、津绿5号、津春4号等。最好选用经过有机认证或经过转化的种子，在无法获得经认证的有机种子和种苗的情况下(如在有机种植的初始阶段)，可使用未经禁用物质处理的常规种子。禁止使用任何转基因黄瓜品种。
3、轮作换茬
黄瓜至少要经过3年的轮作。最好实行水旱轮作，如与水稻轮作，有利于减少病虫草害的发生。
4、深耕整地
在黄瓜播种的上年冬季，进行瓜田深翻晒土、冬闲冻垡，以杀死病菌和越冬虫卵。
5、土壤消毒
4月上、中旬黄瓜播种前，结合播种前整地每667 m2均匀撒施75 kg熟石灰。
6、种子消毒
在播种前把种子晒1～2 d，杀死种子上的病菌及害虫，但不得在水泥地面上晒。
7、培育壮苗
黄瓜在3月上旬至8月上旬均可播种，保护地种植最早可于1月下旬播种。每667 m2大田需苗床面积10 m2，用种量100～150 g，最好采用营养钵、营养块育苗。营养土配制：用未种过瓜类的肥沃无病表土，掺入30% EM有机肥，充分混匀，装入营养钵和育苗盘。插种前用55℃热水烫种10～15 min消毒，待水温降到25℃时，浸种8～10 h，搓洗，清水淘净。出苗后降低床温，防止发生高脚苗。育苗后期加强低温锻炼。
8、合理密植
整地时需深耕，施足基肥，每667 m2用腐熟农家肥1500～2500 kg，磷矿粉50 kg，与土壤混匀，然后做畦。多雨季节一般采用高畦种植，包沟1.5 m左右。当气温稳定升到10℃以上，幼苗2～3片真叶时，择晴天单株定植，每畦栽2行，株距25～28 cm，每667 m2栽3200～3500株，随后灌定根水。
9、科学管理
通过插架引蔓、改善黄瓜通风透光、调控肥水等科学管理方式，增强植株抗病能力，减少有机黄瓜病虫草害的发生。同时，及时摘老叶打权，人工拔除病虫为害株，及时清除田间病株残体，集中销毁，有效减少菌源。
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