1、选择抗病品种适时播种
选择抗病品种如甘蓝型油菜华油8号、铁杆青等，并于9月底和10月初播种，发病较轻。
2、实行轮作
由于休眠孢子囊的抗逆性很强，因此发病严重的油菜田，要实行4-5年的轮作，在规定轮作的年限内不种油菜和十字花科蔬菜，可改种麦类和绿肥。
3、育苗移栽
选择无病地块培育壮苗，五叶期以后移栽是防治根肿病较理想的措施。
4、加强苗床和大田消毒
用敌黄钠或五氯硝基苯等药剂消毒。
(1)苗期可在育秧是进行苗床消毒，每平方米苗床用敌黄钠或五氯硝基苯10—20克加细土5—6公斤拌成药土均匀撒施;
(2)大田直播和移栽时，每亩用敌黄钠或五氯硝基苯等药剂2—3公斤加细土40—50公斤配制成药土，播种时先将药土施入播种沟内再种，或施入定植穴内再定植。必要时可用敌黄钠或五氯硝基苯800—1000倍液灌根，每株灌药液0.5公斤。
5、改造酸性土壤
结合整地在酸性土壤中增施草木灰等碱性有机肥或每亩施石灰100—150公斤，实行掺砂土改造酸性土壤，缓解根肿病的发生。
6、栽培管理
加强田间水浆管理，注意开沟排水，避免田水浸灌。应选择晴天定植，生产实践证明：定植后有1-2周的晴天，就能大大减轻发病;如定植时下雨或植后不久下雨，淋施2%石灰水，可减轻发病，注意收集病株，及时加石灰覆盖深埋，促使菜根腐烂和病菌死亡。如用带菌菜根制作堆肥时，必须充分腐熟后方可施入大田。注意氮、磷、钾配合使用，勿偏施，过施氮肥。
7、化学防治
药剂防治的关键时期是油菜三叶期，用敌黄钠盐500倍液、菌毒清200倍液隔10天灌根1次，连续防治2-4次，防效可达60%以上。播种期每亩用石灰50-75千克或碳酸钠25-35千克穴施，防病效果可达60%左右。用草木灰穴施也有一定防效。
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