黑斑病为紫菜薹的主要病害，分布广泛，发生普遍。保护地、露地都发病，多在春秋两季发生，通常病情较轻，对生产无明显影响。病害严重时，使植株部分下部叶片黄化坏死，明显影响产量和质量。
【症状】
此病全生育期都可发生，主要为害叶片，在叶面初生黑褐色至黄褐色稍隆起小圆斑，以后扩大成边缘为苍白色中心部淡褐至灰褐色病斑，直径3～6mm，同心轮纹不明显，湿度大时病斑上产生稀疏灰黑色霉状物，即病菌分生孢子梗和分生孢子。空气湿度较低时，病斑发脆易破裂，严重时多个病斑汇合致叶片局部枯死。茎和花梗染病，病斑多为黑褐色椭圆形斑块。
【病原】
Alternaria raphani Groves et Skoloko属半知菌萝卜链格孢真菌。病菌分生孢子梗较短，不分枝，单生或2～6根束生，正直或具1个屈曲，隔膜2～6个，淡榄褐色，顶端颜色略浅，基部细胞稍大，大小为12.5～60.5μm×3.0～7.5μm。分生孢子倒棒状，单生，淡榄褐色，具4～10个横隔膜，0～2个纵隔膜，分隔处明显缢缩，大小为36.5～115μm×12～18.5μm。喙胞较长，顶端色淡，不分枝，具1～4个横隔膜，大小为22～108μm×3.5～12μm。
【发病规律】
病菌以菌丝或分生孢子随病残体越冬或越夏，也可在种株或种子表面上残留。条件适宜时进行初侵染，发病后产生分生孢子借气流传播蔓延，形成再侵染，使病害扩展蔓延。病菌喜欢较低温度和高湿，10～35℃均可生长，适宜温度为17℃。紫菜薹生长期阴雨较多，或棚室内温暖高湿病害发生严重。
【防治方法】
1.收获后彻底清除病残落叶，减少田间菌源。重病地区实行与非十字花科蔬菜轮作。
2.必要时进行种子消毒灭菌，可选用种子重量0.4％的50％ 扑海因可湿性粉剂或80％ 大生可湿性粉剂拌种。
3.发病初期进行药剂防治，可选用50％扑海因可湿性粉剂1200倍液，或65％多果定可湿性粉剂1000倍液，或50％农利灵可湿性粉剂1500倍液，或50％敌菌灵可湿性粉剂500倍液，或2％农抗120水剂200倍液，或50％克菌丹可湿性粉剂400倍液，或80％大生可湿性粉剂800倍液，或70％代森锰锌可湿性粉剂600倍液，结合防治细菌性病害，还可选用47％加瑞农可湿性粉剂600～800倍液喷雾，10～15天防治1次，根据病情防治1～3次。
