一般来说，二者在外观上差异较大。但有时病害与缺素症在外观表现上会很相似，特别是在发病初期，这样对病害防治带来一定困难。在这种情况下，可从以下3个方面综合考虑进行辨别。
看病症发生发展的过程 蔬菜病害具有传染性。因此，病害的发生一般具有明显的发病中心，然后迅速向四周扩散，通常成片发生，若不及时防治，可给蔬菜生长造成很大危害。而缺素症一般无发病中心，以散发为多，若不采取补救措施，会严重影响产量和品质。
看病症与土壤的关系 蔬菜病害与土壤类型、特性大多无特殊关系。无论何种土壤类型，如有病源，都可在氮肥施用量偏高而又不注意磷钾肥配合施用的田块发生。
作物缺素症的出现则与土壤类型、特性有明显关系。比如北方土壤pH值偏高，不易缺钼，而南方酸性土壤则易缺乏此种元素。对于不同营养水平的土壤，都可发生某种或某些缺素症，但瘠薄土壤多发。
看病症与天气的关系 蔬菜病害一般在阴天、湿度大的天气多发或重发，植株群体郁蔽时更易发生，应注意观察天气及植株群体长势状况，及早防治。
而缺素症与地上部空气湿度关系不大，但土壤长期滞水或干旱可促发某些缺素症。如植株长期滞水可导致缺钾，表现为叶片自下而上叶缘焦枯，像火燎一样。土壤含水量不稳定，忽高忽低，容易引发缺钙，导致脐腐病、心腐病、假黑星病、芹菜茎裂病等生理病害，同时也会不同程度地影响瓜果蔬菜的花芽分化。
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