1.正确选择品种
最好能选用低温条件下花粉多、花粉捻性高、果实酸性小、畸形果少的优良品种。主栽品种花粉量少，还应配栽花粉量多的品种，利于授粉受精完全，减少畸形果，提高大果率。
2.控制温度和湿度
草莓花期应严格控制保护地内的温度和湿度，低温、高温或高湿都易引起草莓畸形果的发生。温度宜控制在20～28℃，要适时放风，以降温降湿。采用长寿无滴膜，可防止水滴对草莓果实的影响，滴灌能有效地降低保护地内的空气湿度。花期只要地表不干，一般不需灌水。
3.放蜂传粉
在寒冷季节，室外气温低，棚室的放风口小、放风时间短，室内处于无风状态，棚室外寒冷，无昆虫进入，草莓不能借助风力和昆虫来授粉。放蜂传粉是促进授粉受精，防控草莓畸形果形成的有效措施。
在花期前3天将蜂箱放置于棚内向阳处，蜂箱底围铺麦草以增加箱内温度，促使蜜蜂在低温条件下提高采粉力，每亩棚室面积投放一箱蜜蜂授粉，辅以蔗糖水(1∶1)作为蜜蜂的补充营养，保持棚室通风，严禁使用农药。与不放蜂区相比，此项措施可提高草莓的授粉受精结实率，使草莓正常果增加近3倍。
4.合理疏花疏果
合理疏花疏果可明显降低草莓的畸形果率，且有利于集中养分，提高单果重及果实品质。疏花应疏去弱势花、低位花和叶内花，疏果应疏去畸形果、僵果和虫蛀果。
5.合理施肥
棚室草莓结果期长，对氮、磷、钾三要素的需求较多，在重施基肥的基础上，及时补充肥料。从封闭棚室到草莓现蕾，一般15天左右追肥一次，亩追三元复合肥15公斤；从顶花序现蕾到果实采收前，每20天追肥一次；从第一次采收高峰后，每30天追肥一次。要增施磷、钾肥，不要追施碳铵。
追施三元复合肥或尿素时，要加水化开后打孔追施，在开花结果盛期，一般需亩追施标准复合肥20公斤。在第一批果实采收后，进入第二批盛花期时，叶面喷施0.3%磷酸二氢钾溶液，每5～7天喷施1次，连续喷施2～3次。
6.减少用药次数
防治保护地草莓的病虫害，应采用以农业防治为主的综合措施，尽量不用药或少用药。花期喷药易引起畸形果的发生，特别是当日开放的花朵更是如此。若病虫害较严重，则应注意在花前花后用药。
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