水稻烂秧病是由于低温缺氧易引致发病，寒流、低温阴雨、秧田水深、有机肥未腐熟等条件有利发病。烂种多由贮藏期受潮、浸种不透、换水不勤、催芽温度过高或长时间过低所致。烂芽多因秧田水深缺氧或暴热、高温烫芽等引发。青、黄苗枯一般是由于在3叶左右缺水而造成的，如遇低温袭击，或冷后暴晴则加快秧苗死亡。
发病症状
烂种指播种后种子腐烂不发芽。
烂芽指萌动发芽至转青期间芽、根死亡的现象。分生理性烂芽和侵染性烂芽。
生理性烂芽常见有：
1.淤籽。播种过深，芽鞘不能伸长而腐烂；
2.露籽。种子露于土表，根不能插入土中而萎蔫干枯；
3.跷脚。种根不入土而上跷干枯。
4.倒芽。只长芽不长根而浮于水面；
5.钓鱼钩。根、芽生长不良，黄褐卷曲呈现鱼钩状；
6.黑根。根芽受到毒害，呈“鸡爪状”种根和次生根发黑腐烂。
侵染性烂芽又分为绵腐型烂芽和立枯型烂芽。绵腐型烂芽在低温高湿条件下易发病，发病初在根、芽基部的颖壳破口外产生白色胶状物，逐渐长出绵毛状菌丝体，后变为土褐或绿褐色，幼芽黄褐枯死，俗称“水杨梅”。立枯型烂芽开始零星发生，后成簇、成片死亡，初在根芽基部有水浸状淡褐斑，随后长出绵毛状白色菌丝，也有的长出白色或淡粉红霉状物，幼芽基部缢缩，易拔断，幼根变褐腐烂。
死苗指第1叶展开后的幼苗死亡，多发生于2～3叶期。分青枯型和黄枯型两种。青枯型：叶尖不吐水，心叶萎蔫呈筒状，下叶随后萎蔫筒卷，幼苗污绿色，枯死，俗称“卷心死”，病根色暗，根毛稀少。黄枯型：死苗从下部叶开始，叶尖向叶基逐渐变黄，再由下向上部叶片扩展，最后茎基部软化变褐，幼苗黄褐色枯死，俗称“剥皮死”。
防治措施
防治水稻烂秧的关键是抓育苗技术，改善环境条件，增强抗病力，必要时辅以药剂防治。
1.防烂种。浸种前稻种要晒得燥、选得净，浸种时要浸得透、消毒严。
2.防烂芽。选择背风向阳、排灌方便、土质疏松、肥力较高、未施用除草剂的田块。
3、防绵腐病。可用70％敌克松500倍液浇灌。
4.防立枯病。该病一般在温度较高且秧苗缺水时发生，可通过换清水1～2天后排干的方法进行补救。也可在下午4点后用18％噁霉灵0.1克或79％敌克松500倍液进行苗床喷雾，秧苗2～3天即可返青。
