烟草花叶病毒病主要发生流行时间是在苗床期到大田现蕾期，北方一般为每年4—6月，这一段的气候条件对发病影响很大。如果干旱少雨，气温波动较大，烟苗移栽后雨水不足，或突降冷雨，都容易引起烟草花叶病毒病的暴发流行。栽烟后未下透雨，前期烟株未长起来的烟田发病重。
烟草花叶病毒存在于粪肥、土壤中病株残体上，如烟秆、烟杈、碎烟叶、种子等，当烟叶有轻微伤口时，病毒就可以进入植株，引起发病。手和工具接触发病植物，会沾上病株汁液，再触及健康烟株时，会导致发病和重复侵染。
烟草花叶病毒病防治方法
一、农业防治
1.种子处理
种子要从无病田的无病株上采收，避免病株残体混入种子中；育苗前要水选或风选，充分去除花、果、叶的碎屑；洗种前用0.1%硝酸银或0.1%硫酸铜泡10分钟，除去种子表面病毒，再用清水反复冲洗，除去残留药液后播种育苗。
2.苗床选择
苗床要尽量远离菜地、烤房、晾晒棚及烟草公司仓库等毒源多的场所，苗床土壤要熏蒸消毒，要用营养钵育苗。严禁蔬菜和烟叶同床育苗。
3.田间操作
间苗、假植、定植等大田管理时，手和工具用肥皂水或抑传灵100倍液消毒，或在假植前和移栽前用抑传灵100倍液喷施苗床，先处理健康植株，后处理病株。早期发现病株及时拔除，更换健苗。
二、药剂防治
抗病毒药剂施用重点体现一个“早”字，从苗期开始使用，苗期用药1次，大田期用药2～3次，每次间隔7～10天，特别注意在移栽前用药1次，以防止移栽时的摩擦传染。目前国内的抗病毒药剂有嘧肽霉素、菌克毒克、植病灵、病毒必克、毒消、病毒A等。
1.抑传灵防治
抑传灵是由脱脂奶粉和表面活性剂组成，可钝化病毒，使病毒不能侵染植物。
2.嘧肽霉素防治
2%嘧肽霉素水剂是一种高效、低毒、无残留、无公害生物农药，兼备预防和治疗功效，对烟草病毒病有显著防效。一般稀释400～600倍喷施，作为预防用药；一般在苗期、旺长期和初花期各喷一次，作为治疗用药；一般喷施两次，间隔5～7天，重症区可适当增加喷施次数。
