1.除草剂药害因素。两类地块会引起除草剂药害，一类是常年连作的老棉田，因常年使用氟乐灵且使用量偏大，造成植株茎秆细弱矮小、红茎比例较大。另一类是种棉花的倒茬地，前茬作物为玉米，并且连年使用玉米田封闭性除草剂乙阿合剂或丁阿合剂。多年连续使用，使除草剂在田间残留，当夏季降水量较大时，田间除草剂随着水的流向低洼处，表现为同一块地内高处棉田生长健壮，低洼处或低洼地段，植株矮小、细弱，出现红茎棉现象。
2.病害因素。棉花枯萎病根据受害时期和严重程度，其中在田间有的表现为紫红型，子叶和真叶变紫红色或出现紫红色斑块，略呈萎蔫状。
3.土壤或盐或碱。有些地块由于长期不合理施用化学肥料而不施用有机肥，造成土壤盐碱化或次生盐渍化。当下雨量较小时，造成盐分上移，盐分浓度大抑制了根系对营养的吸收，出现了盐害伤苗现象，也造成植株生长缓慢而小、红茎比例偏高。
防治措施：
1.如果发生茎秆发红的是多年连作病害严重的老棉田，第二年可与禾本科或豆科等作物轮作倒茬。换句话说，在条件允许的情况下，这样的轮作是最好的措施。
2.对于已经发生病害的矮小植株，要及时喷洒杀菌剂，并结合优质叶面肥进行喷雾。也可对病株进行灌根效果好于喷雾，隔5-7天再灌根一次。
3.对盐碱化或次生盐碱化土壤，可通过连续几年增施有机肥加以改良，一旦出现小水“勾盐”现象，立即选用淡水浇灌压盐减轻盐害。
4.对于除草剂药害造成的植株生长不良，立即喷洒“920”或硕丰481加入优质叶面肥进行缓解。有条件的还要及时浇水，底肥不足或有脱肥症状的，要结合浇水每亩追施尿素12-20斤，促进植株生长。
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