主要原因有三点：一是未能掌握用药适期；二是用药期间遇连续阴雨天气，影响药效发挥；三是长期使用多菌灵等苯并咪唑类药导致菌核病病菌对这类药产生抗性。防治油菜菌核病，应确保在关键时期全面用好一次药，力争用好第二次药，同时提高防治质量，确保防治效果。
1、掌握用药最佳时期
菌核病病菌先侵染油菜花瓣，然后通过带菌的花瓣侵染茎、叶和分枝，最终导致油菜茎秆发病，油菜开花期是药剂防治的关键时期。从试验和大面积推广应用结果看，防治油菜菌核病药效最佳的时期为油菜主茎开花株率95%～100%时，为方便用药，生产上可适当提前至油菜主茎开花株率达80%时用药。花期阴雨天多的年份，隔5～7天再防治一次。
2、选准对路药剂
有试验表明，菌核病病菌对多菌灵等苯并咪唑类药已普遍产生高水平抗性，不宜再单独用来防治菌核病，宜换用咪鲜胺、氯啶菌酯、腐霉利、菌核净、福·菌核或这些药与多菌灵的混配剂防治。长势较差的田块可喷施适量叶面肥，以增强植株抗逆性。
3、采用细喷孔喷雾
有试验表明，在同等用药剂量下，采用不同孔径的喷头防治油菜菌核病，防效有显著差异。选用孔径0.7毫米的喷头，每亩加水15～20公斤，或者选用孔径l毫米的喷头，每亩加水40～50公斤喷雾，农药利用率和防治效果显著提高。
防治油菜菌核病应大力推广应用弥雾机和低容量喷雾，手动细喷雾每亩用水量50公斤，机动弥雾每亩用水量30公斤，这样雾滴细、附着力强，能明显提高农药利用率和防治效果。施药时植株上下要喷到，以提高防效。
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