它一般分为普通花叶病（TMV）和黄瓜花叶病（CMV）两种。普通花叶病主要靠田间的农事管理操作造成病害的传染，种子、粪肥、土壤中的病株残体是主要的传染来源。
而黄瓜花叶病主要靠蚜虫迁飞进行传染，同时也能通过打顶抹芽等农事操作中的汁液摩擦传染花叶病病毒，CMV主要在越冬蔬菜、农田杂草上越冬，烤烟现蕾前田间带毒蚜量较大，气候干旱，旺长前后气温波动较大，出现冷雨或热风，病害往往发生重。
烤烟花叶病主要以农业措施预防为主，配合有效的抗病毒药剂，能起到一定的防治效果。
农业预防措施：
1、合理布局，实行麦烟套作和空土栽烟。
2、及时拔出烟地残茬，提早翻犁炕冬，不使用掺有烟株残茬的有机厩肥，尽量减少病害来源。
3、使用包衣良种，推行集约化漂浮或托盘育苗，常规育苗不使用猪粪水浇淋苗床，实行"净土、净肥、净水"育苗，培育烤烟无病壮苗。
4、5月上中旬适时移栽，根据烟地肥力，适当控制施氮量，实行扩行缩株，合理密植。移栽大田后如发现病苗，应及时用锄挖出，另换工具补栽健苗。栽后20天内要及时中耕除草追肥，加强田间管理，促进烟株早生快发，增强烟株抗病抗逆性。
5、规范农事操作管理，注意田间卫生。田间农事操作时禁止吸烟，育苗剪叶锻苗时，先用肥皂洗手，并清洗消毒剪刀，大田农事操作要按先无病后病地，先健株后病株顺序进行，要及时清理烟地病株，打下的烟花烟杈要远离烟地集中坑埋处理，减少病害传染源。
化学防治：
1、假植前、剪叶前喷施病毒抑制剂（菌克毒克、病毒必克、毒消、抑毒星等），预防花叶病。移栽前最好再用抗病毒药剂对苗床普防一次。
2、栽后7--30天内，用病毒必克600倍液、菌克毒克250倍液、抑毒星500倍液或毒消600倍液喷施2--3次，对控制花叶病的发生有一定防效。
