气候性斑点病是因空气中突然增加的臭氧通过烟叶表面的气孔进入气腔内，浸染叶片内的幼嫩组织（栅栏组织），使原生质浓缩，细胞壁瓦解，形成的病斑。
因烟株的中上部叶片的气孔数量比顶叶多，关闭速度比顶叶慢，且叶片在水分多，湿度大时，气孔张开度大，所以最先表现出症状的部位一般是中上部叶或下部叶。
据调查表明，臭氧毒害是感染气候性斑点病的主因，但低温，特别是烟株旺长阶段气温下降，土壤中缺磷时气候性斑点病会加重。
防治气候性斑点病的药剂有甲基托布津，代森锌等，该类药剂起作用不是因为它能去掉或降低臭氧浓度，而是因为它里面含有抗氧化剂，喷施在叶片表面能使烟叶表面的气孔关闭，防止被氧化。根据这一防治机理，我们还可以选用波尔多液，它是一种悬浮剂，能在叶片表面形成一层保护膜，隔离臭氧。
炭疽病是由半知菌亚门的黑盘胞菌寄生在病株残体、土壤、肥料中，这类真菌经常产生扁平开口盘状的分生孢子盘，随着风吹或雨水反溅作用，将病菌带至叶面，病菌的吸盘牢牢吸住叶面，进而浸染叶内细胞。
它是浸染性病害，防治该类病害主要采用能够杀死半知菌类的杀菌剂，如甲基托布津、多菌灵、退菌特，此时虽然甲基托布津对该病起作用，不是因为里面的氧化剂，而是因为里面的主要成分能够杀死该病的致病病菌。
病原是病害发生的原因的统称，既然了解了病害的病原，根据病原就能区别两种病害的病征：
1、二者发病时间不同。炭疽病在烟株的整个生育期均可发病，气候斑主要在移栽还苗后至团棵旺长发病。
2、发病部位不同。炭疽病在叶片、叶柄、茎、花、果及种子上均可发病，而气候斑仅危害叶片，且斑点主要集中在叶尖，叶缘及叶脉附近，不危害叶脉及叶柄。
3、病斑形状不同。炭疽病病斑圆形或近圆形，而气候斑呈不规则形，病斑较炭疽病小。
4、炭疽病斑在潮湿条件下可以产生黑色小粒点（半知菌的分生孢子盘—黑盘胞菌），甚至有淡粉色的黏液（分生孢子），而气候形斑点病则无病征。这是最重要的一点区别。
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