该病主要危害1-2年生幼苗，高温条件下，是诱导茎腐病的主要原因。在高温下苗木受损伤，抗病性减弱，病菌生长繁殖快，从苗木伤口侵入，引起病害发生。另外，苗圃地低洼积水，苗木生长不良容易发病。在6-8月天气持续炎热时发病重。
提早播种，在高温季节来临之前提高幼苗木质化程度，增强对茎腐病抵抗力，并进行苗圃土壤消毒，适当遮荫，及时灌溉。在发病初期用50%甲基托布津1000倍液进行防治。
二、霉烂病
在贮藏期危害银杏种仁，在温度20℃左右，湿度较大的条件下蔓延致病，未成熟或破碎种子发病较多。
种子必须充分成熟后采收，同时避免损伤种皮。贮藏前要充分凉干，拣去碎种、病种，贮藏室要保持低温，并注意通风。贮藏前用0.5%高锰酸钾溶液浸种30分钟，或用40%甲醛稀释10倍液喷洒消毒。
三、叶枯病
病原菌主要在落叶上越冬，翌年3月间形成孢子，侵染新叶。苗木6月初发病，8-9月为发病盛期。一般苗木发病率比大树高。
加强管理，清除落叶，适当施肥。合理配植树种，防止与水杉、松、茶、葡萄套种。幼树和大树在7月上旬发病初期用40%多菌灵500倍液进行防治，苗木防治时间大约在6月上旬到8月下旬，同时加入0.5%磷酸二氢钾、0.2％尿素液进行喷施，增强其抗性。
四、干枯病
病菌自伤口侵入主干或枝条，在光滑树皮上形成不规则病斑。以风、雨、昆虫与鸟类传播，5月后树干出现新病斑，7-9月份为发病盛期。
保护树体，防止创伤，增强树势，提高抗病力。清除重病植株和有病枝干并及时烧毁，枝干或枝条上病斑，刮除后用10%碱水涂抹，效果很好。
五、银杏大蚕蛾
为大型蛾类，1年发生1代。以幼虫取食叶片。初孵幼虫有群居习性。1-2龄幼虫能从叶缘取食，但食量很小，4龄后分散危害，食量渐增，5龄后进入暴食期，可将叶片全部吃光。
8-9月用黑光灯诱杀成虫。在幼虫3龄前摘除群集危害的叶片。发生严重时，在低龄幼虫期喷洒2％溴氰菊酯2500倍液或90％敌百虫1500-2000倍液。
六、桃蛀螟
1年发生1代。幼虫孵化后先做短距离爬行，后蛀入种核内危害，将种核全部吃光或只剩下一部分，1头幼虫1生只取食1个种实。
第1代成虫羽化时用80%敌敌畏1000倍液防治。卵孵化盛期可喷洒40%杀螟松1000倍液，7天后喷第2次药，杀灭卵孵幼虫。
七、枯叶夜蛾
以成虫吸食果实汁液，银杏果实受害3-10天内即脱落。卵多产于通草、十大功劳等寄主的叶背上，幼虫老熟后入土室化蛹。
铲除银杏周围的通草、十大功劳等寄主植物。在5月初至6月中旬喷洒50%敌百虫500倍液，10天后再用药1次，傍晚用药效果最佳。
八、茶黄蓟马
成虫、若虫均危害苗木和成年大树叶片，在叶背面吸食汁液，吸食后叶片很快失绿，严重时叶片白枯，导致早期落叶，干旱条件适宜于蓟马发生，随着温度升高，从幼苗转到大苗和大树危害。
蓟马抗药性差，及时喷药易收到效果，在6-8月高发期用80%敌敌畏1000倍液防治，连喷2次，有良好效果。
九、银杏超小卷叶蛾
以幼虫钻入枝条危害当年新梢，造成枯枝、落叶、落果。该虫具有喜光特性，林缘周围比林内发生重。发生程度与温度密切，随着海拔与纬度升高，年平均温度降低，虫口密度随之减少。
成虫羽化盛期前用2.5％溴氰菊酯2500倍液进行防治。幼虫孵化初期用80%敌敌畏乳油800倍液喷洒被害枝。
十、豆荚螟
以幼虫蛀入种核内危害，并有转果危害习性。严重时种实核仁被吃光，种核内只留下虫粪，严重影响银杏种实的产量和质量。由于幼虫钻入土化蛹，其发生与土壤湿度和质地有密切关系，降雨多、土壤坚实则发生较轻。
周围不种其他豆科植物、以减少豆荚螟转移繁殖危害。在成虫盛发期，用50%敌敌畏或90%敌百虫800倍液喷施，10天后第2次防治，有很好效果。银杏，其种子即白果可入药，有滋阴补肾、润肺止咳、平喘防虫作用，常见病虫有银杏茎腐病、霉烂病、叶枯病、干枯病、银杏大蚕蛾、桃蛀螟、枯叶夜蛾、银杏超小卷叶蛾、豆荚螟、茶黄蓟马等。
