大棚畸形菇主要有：空心白根菇、硬开伞、死菇、薄皮开伞菇、鳞片菇、不分化的子实体。
他们的发生原因和农药防治方法如下：
1、空心白根菇 菇柄疏松变白，严重时收缩形成中空。发生原因：在子实体生长阶段，由于空气干燥和高温引起。当空气相对湿度在85%以下，覆土层含水量较少，菇房内气温在18℃以上时，蘑菇生长快，水分蒸发也快，导致菇体内吸收的水分小于蒸腾的水分而造成。防治方法：白天及时喷水，使空气相对湿度保持在90%，早晚喷水后及时通风，降低菇棚温度，保持在14～18℃。
2、硬开伞 菌幕和幕柄分离，开伞过早，导致商品性差。发生原因：出菇初期，突遇低温，高温骤降，温差大，菇房湿度偏低造成。防治方法：加强菇棚保温措施，注意天气变化，缩小温差，保持菇房内空气相对湿度在适宜范围内。
3、死菇 出菇期幼菇萎蔫变黄，停止生长最后死亡，轻则成片死亡，重则成茬死亡。发生原因：①温度过高。秋末春初温度高，造成菇体营养倒流，缺乏营养而死亡；②覆土后菌丝的生长过快，出菇较密，营养供应不上，造成幼菇营养不良而死亡；③菇房通风不及时，氧气不足，二氧化碳浓度高；④菇棚气温较高（超过20℃），湿度过大（超过95%），喷水后通风不及时，菇表面积水，造成小菇缺氧窒息死亡。防治方法：掌握播种时间，防止高温季节出菇；播种量不要过大，防止菌丝生长过旺，出菇过密，造成营养缺乏；覆土层含水量不要过高，压低出菇部位，避免出菇过密，同时喷水降温要及时通气，防止菇表面积水。
4、薄皮开伞菇 菇柄细长，菌盖薄，早开伞。发生原因：出菇盛期，菇房内气温20℃以上，空气相对湿度过大，通风不良，再加上床面菇出得密、出得快，相互争夺氧气和养分造成。防治方法：栽培料发酵要彻底，喷水后及时通风，防止菇表面积水，保持菇棚气温适宜。
5、鳞片菇 菌盖龟裂而产生鳞片，形成鳞片菇。发生原因：菇房内气温14℃以下，湿度偏小，温差和干湿差过大造成。防治方法：出菇期间棚内保持适宜的空气相对湿度，加强保温措施，避免出现过大的温差，防止大风突然袭击。
6、不分化的子实体 有菇蕾而子实体未分化，没有菌盖和菌根，只形成一个菌丝团。发生原因：①菌丝生长到一定程度，环境条件适宜菇蕾的形成，而后又不适宜子实体分化造成。②农药杀菌剂使用不当，过量使用农药均会形成不分化的子实体。防治方法：播种前将菇房四周清理干净，彻底消毒菇房，防止病虫害发生，合理安全使用农药，防止过量。
