菠萝常见病虫害有凋萎病、黑腐病、苗心腐病，常见的虫害是蟋蟀。如何防治这些病虫害，正确使用农药防治，对于菠萝的产量质量息息相关。
黑腐病 ，受害果心变黑，逐渐扩大至全果腐烂，病菌多由摘芽处及采果的果柄伤口侵入。防治方法：注意不要在雨天打顶及采果，以减少病菌入侵机会。此病也是贮藏菠萝鲜果的主要病害。
凋萎病，植株发病后，叶片变软下垂，叶色淡绿至红色，基部腐烂，最后全株枯死。此病是粉蚧壳虫为害所引起。防治方法：首先严格注意不用病苗繁殖。其次及时扑灭粉蚧壳虫，定植时用500倍乐果溶液浸头，倒置凉干后种植。种后发现粉蚧壳虫为害，及时喷乐果500倍液，或25%中科美铃1500倍液。若发现病株，及时挖 除，以防蔓延。
苗心腐病，幼苗烂心死亡。主要是堆放发热或积水引起。防治方法：避免种苗堆放过久，特别是远途运输过程中应尽量减少堆放过久，以免因高温、高湿和不透气致发热伤苗。运到目的地即行摊开，略晒1~2天后种植，避免雨天种植，注意深耕浅种。
蟋蟀，在果实成熟时被大头蟋蟀咬伤，会使果实品质差，成为级外果。防治方法：用米糠5干克炒熟番薯1千克调入少量咸菜汁，再加90%晶体敌百虫100克，做成豆粒大小的毒饵，在晚上将每饵撒子植株周围诱杀。
