苹果落花后的病虫防治应与全年重点病虫防治相结合。主要病虫有：苹果绵蚜、金纹细蛾、斑点落叶病、霉心病及缺素症。苹果落花后需要进行农药防治的病虫有苹果叶螨、轮纹病等。
1.苹果绵蚜。每年大约发生17代，以1、2龄幼虫在树体中下部粗糙处及近主干的土层中越冬，4月上中旬开始活动，5月初开始扩散在6月和9月有两次危害高峰。苹果落花后为适宜防治时期，常用的药剂有48％乐斯本1500倍液、10％吡虫啉2000倍液、5％啶虫脒2000倍液及复配制剂等。重点喷洒树干。
2.金纹细蛾。每年发生大约5代，以蛹在被害叶中越冬，越冬成虫在4月初初发，在苹果落花后的4月末盛发，以后各代的成虫盛发分别在6月初、7月初、8月初、9月中下旬。成虫盛发后期为防治适宜期，常用的药剂有50％杀虫剂辛硫磷1000倍液、25％灭幼脲3号1500倍液、20％氰戊菊酯2000倍液等。重点喷洒叶背面。
3.苹果叶螨。叶螨有3种：山植叶螨、苹果全爪螨、二斑叶螨。山楂叶螨每年发生6～10代，以雌成虫在苹果主干上越冬，苹果落花后爬到树的内膛新叶背面危害，发生整齐、数量少。苹果全爪螨每年发生6～7代，以卵在当年生枝上越冬，苹果落花后已出现第二代若螨。二斑叶螨的发生与山植叶螨相近。苹果落花后主要防治若螨和成螨，常用的药剂有15％哒螨灵2000倍液、1.8％阿维菌素3000倍液及复配制剂等。
4.霉心病。据中国农药网了解，主要发生在红星系列品种上。病原腐生性强，在果园树体或杂草等多种场所越冬，花期侵入，果实成熟及采收后表现症状。防治霉心病在初花期可以用45％硫悬浮剂400倍液，盛花期用10％多氧霉素（宝丽安）1500倍液，落花后用50％多菌灵500倍液或40％福星8000倍液等。
5.斑点落叶病。主要发生在红星系列品种上。病原以菌丝在受害叶片、枝条、芽上越冬，在枝条速长期侵入，并可以多次侵染。苹果落花后可以用10％多氧霉素（宝丽安）1500倍液、50％扑海因1200倍液、80％代森锰锌800倍液进行防治。
6.轮纹病。主要发生在富士系列品种上。病原在主干上越冬，春季温度回升后散发孢子，侵入枝条。轮纹病是苹果的重点病害，要定期防治，特别要重视前期和中期防治。常用的药剂有80％代森锰锌800倍液、70％杀菌剂甲基托布津800倍液、80％乙磷铝600倍液、50％多菌灵500倍液、40％福星8000倍液等。
7.黑点病。只在套袋果实上发生。病原在病果和病叶上越冬，落花后10～30天为侵染用药防治方法同轮纹病。
