液体农药注意隔热防晒，避免高温、接触空气；远离火源，防止接触氧化和碱性物质，宜放在通风避光、阴凉干燥的地方，不要和硝酸盐、强酸等物质及木炭、纸屑等有机物放在一起。瓶装农药的瓶盖、瓶塞必须拧紧盖牢，防止挥发分解。有些农药又有各自的特性，如辛硫磷和氟乐灵等，储存时不要与碱性物质混放在一起。瓶装液体农药遇0℃以下低温容易结冰，形成块状或使瓶子冻裂，最好用稻壳等物保温防冻。
固体农药主要注意隔湿防潮，用木板或晒干的谷壳、麦秸、稻草等做铺垫，并注意通风散湿。烟雾剂存放时不可与易挥发、易燃、易爆物品放在一起，温度也不要超过30℃。
微生物农药在低温干燥的环境中保存，防高温防潮湿，保存时间不要超过2年
