菟丝子是一种生理构造特别的寄生植物，其组成的细胞中没有叶绿体，利用爬藤状构造攀附在其他植物，并且从接触宿主的部位伸出尖刺，戳入宿主直达韧皮部，吸取养分以维生，更进一步还会储存成淀粉粒于组织中。生产上通常在大豆播后苗前用乙草胺、仲丁灵（也可以在大豆生长期使用）等药防除，但效果不理想。实践证明，用草甘膦防除大豆田菟丝子效果好。
草甘膦属灭生性除草剂，大豆对该药有较强的抗耐性，而菟丝子对该药的抗耐性差。掌握在菟丝子转株危害前，用10%草甘膦水剂400倍液对准受菟丝子危害的植株喷雾，不要喷到其他植株上。一般喷药后10～15天菟丝子大量死亡。施药后3～4天大豆叶片开始黄化，出现轻微药害症状，但对生长发育没有大的影响，7天后黄化株率不再增加，10天左右叶片恢复正常生长。由于菟丝子在田间不断发生，需在首次用药后两周左右查治一次。
