香菇主要病害是绿霉、链孢霉、青霉。他们的病症、发病原因和农药防治方法如下。
一、链孢霉
1、症状及病因 菌丝初为白色，后逐渐为桔红色，传播速度极快，有的栽培者因菌袋受其污染出现“满堂红”。这种杂菌易于在高温高湿条件下发生，由于菇房湿度过大或培养料灭菌不彻底而常发生。
2、防治措施
（1）配制培养料可用1∶800多菌灵溶液拌料能有效控制链孢霉。
（2）接种时严格无菌操作。
（3）菇房内菌袋排叠环境要干燥，防潮，防高温。
（4）一旦发现可用石灰粉盖在要害处，并用浸过0.1%高锰酸钾溶液的湿布包上拿到远处深埋,以免污染空间.
二、青霉
1、症状及病因 菌丝前期为白色，后转为青绿色、蓝灰绿色。适宜在20℃～25℃的温度范围和酸性环境中生长繁殖。
2、防治措施
（1）加强菇房通风，降低湿度，减轻危害。
（2）局部发生可用40%甲醛溶液或5%～10%石灰水冲洗擦拭受害处。
三、绿霉
1、症状及病因 危害初期呈白色，后期深绿色，菌落中央为深绿色，向外逐渐变浅，严重的使菌袋培养基全部变成黑绿色并发臭松软。发病主要原因是培养料灭菌不彻底；接种时没有达到无菌操作；菌袋封闭不严；长期通风不良，空间相对湿度过高；易于在15℃～30℃温度范围及偏酸性环境中发病。
2、防治措施
（1）培养料灭菌一定要彻底，培养料预湿要均匀，才能彻底灭菌。
（2）接种时严格执行无菌操作。
（3）使用甲醛等酸性消毒剂不要太过量，以免造成酸性环境。
（4）菌袋面发现绿霉，可用75%的酒精或2%甲醛和2%石碳酸混合液装入针筒注入受害处。
（5）若在脱袋后菌筒上发现，可用0.2%多菌灵或石灰浆涂抹于受害处。
