1、当君子兰大部分根系尚好，只烂了一部分根的情况下
发现烂根后立即将其从盆内磕出，去掉附土，用清水把根系冲洗干净，再用洁净的刮脸刀片切除烂根；
然后用0.1％高锰酸钾溶液涂抹在烂根处(或涂以木炭粉、香烟灰等)，阴干3～5小时后即可直接栽种在经过消毒的用松针叶沤制的腐殖土或经过充分腐烂的锯末或山泥盆中。
栽好后盆口套上透明塑料袋，放在半阴处，少浇水，保持盆土略湿润。同时每隔5～7天，向叶面上喷1次0.2％磷酸二氢钾水溶液，以增加养分，促进生根。这样经过两个多星期即可长出新根，此时摘掉套袋并逐渐过度到正常养护。
2、当君子兰根系大部分或全部烂掉了
先用水将茎基部冲洗干净，再用利刀将腐烂部分横向切掉(要求切口平整光滑)，随即在切口处涂抹硫磺粉或木炭粉，以防伤口感染，放在阴凉通风处；
待切口表面稍干后再栽在素沙盆中，两天后浇1次水，以后保持盆土适度湿润，切忌施肥。在20～25℃气温条件下，约经10天之后切口周围即有新根生出，50天后即可移栽在新的培养土盆内，并逐渐转入正常养护。
