神仙洞位于贵州省独山县城南15公里的上道乡麻银寨右侧。民国年间编纂的《独山县志》中记载：“神仙洞......在城南三十里麻银寨后，深数丈，岔洞颇多，内列池石，层见叠出，莫可名状。”据传说，明、清时就有游人入洞观赏洞景。
该洞在寨后龙井大坡半山，由300米的“之”字小径盘旋而上可达洞口。洞口小，高2米，朝向东北。洞口上方有一个穿洞和更高的碉堡洞。神仙洞是一个由地下河系统发展而来的洞穴，地下水发源于甲猛、里腊的“九十九个潭”的地方，流域面积37.5平方公里，平均比降9.5%，总长度为5000米。神仙洞的洞口右下方有三个出水口：一曰水洞，但旱季不出水；二为龙井，是上升泉，最枯水季节流量亦达89升/秒，系承压的结果；三即长潭，为一喀斯特深潭，只见水位升降，不见水流流动。
洞穴共分五层，最高一层是吹风洞（若计碉堡洞，则为六层），海拔1060米，最低层为长潭水下洞穴，海拔835米，故高差可达225米。神仙洞系统由12个洞穴组成，各洞上下连通，交织成网，构成一个复杂而巨大的地下迷宫。其中有2个主洞穴（神仙洞口—断桥、断桥—顶潭），呈东北西南向延伸，几近平行。其他10个洞穴，均属支洞，或向上发育，成为盲井状洞穴，如蝙蝠洞、雪山洞、吹风洞等，或向低处延伸，沟通2个主洞，如平桥洞、斜井洞、楼梯洞等。
神仙洞进口是一个拱形洞厅。顶高30米许，宽20多米，可容300人。洞底平坦，中有一条石铺小路直入洞口。洞口有“天窗”，斜射的亮光，使洞厅内豁然开朗。洞顶倒悬钟乳石，像千百条冰凌，地面有擎天石柱，拔地而起，旁边钟乳石丛生，犹如挺立的“雪松”，因而称“雪松大厅”。稍进，又有一大厅，一条纹石（石幔）如一幅30余米长的帷幕从洞顶垂下，名“玉幕厅”。轻敲重叩，即可发出不同音节的声音。石阶上，有一潭宽3米许，周围石笋像莲花瓣一样排列成簇，潭名“莲花池”，池水清亮，冬暖夏凉。洞顶滴水叮咚，激起阵阵涟漪。水中有一尖塔状石笋，岸边被石花掩映。左转另有一潭，水清见底，名“绿茵潭”。潭边一石笋，高15米。形同孔雀秀尾，石花瓣层层叠叠，名“孔雀开屏”。贴着潭的右壁，登“孔雀开屏”下望，可见梯田连垅，层层叠叠，田水清浅，田埂曲折。其后一座湿淋淋石山，名“滑油山”。由此前进，洞身突然窄小，仅容一人匍匐而过，冷风呼啸，迎面扑来，名“吹风坳”，风力可达5～6级。洞穴中风的吹袭，是空气的流动所致。根据研究，风速大小与洞穴横断面积成反比，即洞穴的横断面大，风速小，神仙洞的“吹风坳”仅容一人通过，故风速很大。再前为“买卖街”，宽敞平坦，长达里许，宽处可达15米。洞底钟乳石遍布，气象万千，是神仙洞里的“大世界”。抗日战争时期，日军轰炸独山各地，乡人就利用此洞点灯赶场，因而命名为“买卖街”，既形象，又有历史意义。
除了上述由碳酸钙沉淀形成各种景观外，还有水流侵蚀，岩层崩塌形成的各种景观。如高达36米，骤见顿觉惊心动魄的“断桥深渊”；险要的地下峡谷，岩石嵯峨，空悬绝壁的“天险腊子口”；深不可测的喀斯特地下深潭；险要难行的“吹风坳”；发出雷鸣般吼声，水势汹涌，如万马奔腾的地下河急流；买卖街右侧“花果山”、“二龙戏珠”、“鲤鱼跳龙门”等石景。神仙洞的景观中，大的似擎天石柱，小的如毛发状的漫枝钟乳石，有倒垂悬挂，有挺拔矗立，有盘旋上升的叶片状，有小巧别致的晶簇状，有玉石般洁白的石幔和石瀑，有如绢似锦的高大帷幕，有茫茫苍苍的“雪山松海”，有丛生争艳的石花和石葡萄，有三旋式石花，有内红外白的石蛋等等。
洞穴中如此众多的堆积物，从科学上分析，主要是由于地下水的化学作用、岩石的崩塌和地下河的机械堆积等而形成的。天空的雨水降落到地面后，不断地从石灰岩的裂缝中向地下渗硫，在地面部位多溶解为土壤空气中的二氧化碳气体，而有机酸等变成带酸性的地下水，进入岩石的内部后逐渐溶解石灰岩，使地下水饱含碳酸钙。下渗过程中进入洞穴后，从洞顶和洞壁中渗流出来。由于环境的改变，引起渗流水的温度、压力和浓度的变化，使碳酸钙沉淀出来。并且可以根据水流的性质，形成不同形状和特性的沉积物。例如从洞顶呈滴水形式下滴的沉积物，主要是钟乳石、石笋和石柱。同时因其来水量不同，可以成为高大粗硕的柱状体，也可以形成密密麻麻的须状细小钟乳石。由滴水生成的景物，大部分成同心圆状，层层包裹，由圆心向外，形成放射状结晶，可以形成玛瑙晕纹，其主要成分为方解石。如果洞顶的渗流量较大时，成片状股状沿洞顶壁洞壁顺流而下，那样就形成景体较大的石帘、石幔、石帷幕、石瀑以及在洞床内的石梯田。各种景物还可以因水流下流时溅起的水珠沉淀出各种附着物，如石葡萄、石花、石榴和石毛等。凡是景观景物很多的大厅或洞穴内，其水汽是十分多的，有的相对湿度可达100%，这种过饱和的水滴，形成一种雾体，有的极细的水珠可以细小到为一滴水的千分之一，这样的水珠变成一种气溶胶状态。气溶胶体和雾滴就依附在其他景物上，久而久之，慢慢地生长，可以将景物装扮得格外妖娆。如很细小的石毛、石刺、石树枝、石花与卷曲石。这种细小的附着体质地一般是非常纯的，多呈碳酸钙本色，洁白如玉，或晶莹剔透。但如果含有微量铁质，则呈现出血红色和肉红色；含铁锰质，为黑漆色；含亚铁和铜盐，变为浅蓝色。色彩灿烂缤纷，极为美观。更有甚者，在洁净的滴水形成的钟乳石的四周，有时出现毛细管状的晶明透亮的管子，这种小管不受地心引力的影响，而且沿着不同方向发展，有的呈树枝分杈，有的为“S”形、发髻形。附着于钟乳石上的卷曲石中，就有这样成因生成的。目前研究的结果表明，洞穴内有一种乳白色的、含有或不含有水分的粉末状或乳状沉积物，称月奶石，是由于细菌参予作用的结果。一般说来，月奶石在北方多是不含水的，南方含水分较多。
无论对神仙洞还是对其他洞穴，很多研究者和观赏者都会谈到洞穴和景物的年龄究竟有多大，是什么时代形成的，离开现在有多久了。确定洞穴的年龄比较困难，目前世界上还没有一种仪器能测量出洞穴生成的时间，但对景物生成年龄的测量则已经有多种科学分析方法。一般常用的测量方法有14C、铀系法、古地磁方法和电子顺磁共振方法。如果估计景物的年龄在6～7万年前以来生成的，可采用14C方法，其精确程度较高；测量40万年前以来的年龄，多采用铀系法较好。目前景物测量年代都采用铀系法，古地磁法测量景物应用的较少，而电子顺磁共振方法的应用则愈来愈广泛。如独山神仙洞系统中，最高的碉堡洞流石生成时间已有30多万年了，穿洞中的石笋最早已有41万年，最晚也有8万年时间了。神仙洞干洞内的石笋最早者为27万年，晚者为15万年，而有水洞穴的钟乳石却不到1万年。从中不难看到，高层洞穴形成的时间较早些，其中景物的年龄也要大些，较底层或者本身就是地下河的洞穴，其生成时间要晚些。但从景物的色彩、游程和游览方式来看，一般低位洞穴的景物色泽鲜艳，活力较大，游程也较长，而且具有泛舟其中，水陆兼游的特点。鬼斧神工神仙洞---中国著名洞窟介绍
